Hato Mayor posee uno de los patrimonios naturales costeros más impresionantes del país. La línea costera comenzando desde la bahía de San Lorenzo pasando por punta Yabón cerca de la desembocadura del río del mismo nombre, punta del Morro, hasta llegar a la bahía de la Jina en La Loma cerca del Seibo, se ofrecen planos paisajísticos espectaculares del Atlántico que se pueden observar por los llanos costeros de Sabana de la Mar, flanqueado por parte de la Cordillera Oriental. Asimismo, en Hato Mayor se encuentran varios de los más importantes recursos hídricos de la Región Este, constituidos especialmente por saltos de agua y lagunas naturales, así como parte de la cuenca hidrográfica del río Higuamo. Entre los saltos más importantes se encuentra el del río Yanigua, también los ríos Casuí y Maguá.
En el territorio de la provincia también se encuentra parte del Parque Nacional Los Haitises uno de los más importantes dentro de nuestro Sistema Nacional de Areas Protegidas.